生物安全柜主要分为三个类型：1. Ⅰ级生物安全柜：主要用于保护工作人员和环境，但不保护样品。这种安全柜的前窗操作口向内吸入的负压气流保护人员的安全，排出气流经高效过滤器过滤后排出保护环境不受污染。适用于不要求对检测样品的保护的实验过程。2. Ⅱ级生物安全柜：用于对人员、样本及环境进行保护，且能满足危害等级Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级致病因子要求。这种安全柜的前窗操作口向内吸入的负压气流保护人员；经高效过滤器过滤的垂直下降气流保护产品；污染气流经高效过滤器过滤后排出保护环境。Ⅱ级生物安全柜又分为A型和B型，A型又分为A1 型和A2 型，B型又分为B1 型和B2 型。3. Ⅲ级生物安全柜：是目前世界上最高安全防护等级的安全柜，适用于高风险的生物试验。这种安全柜的柜体完全气密，100%全排放式，所有气体不参与循环，工作人员通过连接在柜体的手套进行操作，俗称手套箱，试验品通过双门的传递箱进出安全柜以确保不受污染。需要注意的是，生物安全柜的分类方式有多种，这里仅介绍了根据气流及隔离屏障设计结构的分类。
