阴茎短小可以通过口服药物、肌肉注射药物或者手术方式进行治疗，其治疗方式的选择取决于引起疾病的原因。
内分泌发育不良造成的阴茎短小可以采用相应的内分泌治疗，口服或者肌肉注射药物以提高患者的雄激素水平。
阴茎部分缺损或者心理性阴茎短小可以采用阴茎延长手术治疗。
肥胖或者隐匿阴茎导致的阴茎短小可以采用相应的阴茎成形手术治疗。
阴茎短小是指阴茎在疲软的状态下小于四厘米，在牵拉的状态下小于七厘米，在勃起的状态下小于九厘米。
目前造成阴茎短小的原因主要包括内分泌发育不良所致、手术和外伤导致的阴茎部分缺损所致，以及心理性阴茎短小。
