三拜九叩和三叩九拜的区别主要体现在以下方面：1. 动作差异：三拜九叩是指拜三下，每次下拜叩首三次，以示顶礼恭敬，往复三次，稽首顿首，敬之至也。而三叩九拜是指叩三个头，拜九下。2. 虔诚程度：三拜九叩相对于三叩九拜更虔诚，它象征着人三宝精气神，道三宝道经师，天三宝日月星，象征三才。九叩象征纯阳之数，三拜九叩能使阴阳平衡，调七情，去六欲，心态保持平和。3. 用途差异：三拜九叩通常用于封建社会进见帝王及祭拜祖先的大礼，而三叩九拜则主要用于满族的敬老尊上的礼仪，青年人见了长者要垂手站立并要和颜悦色地回答长者的问话。
